5.17.2014

Bioinformatika serta bidang-bidang yang berkaitan




Bioinformatika atau bioinformatics adalah ilmu penerapan teknik komputasional untuk mengelola dan juga menganalisis informasi biologis. Bidang yang mencakup penerapan yakni metode-metode matematika, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah biologis, dengan menggunakan sekuens DNA dan asam amino serta informasi yang berkaitan dengannya.


Sekilas sejarah
Istilah bioinformatics dikemukakan pertengahan era 1980-an pada penerapan komputer dalam biologi. Namun penerapan bidang-bidang dalam bioinformatika sudah dilakukan sejak tahun 1960-an. Kemajuan teknik biologi molekular dalam mengungkap sekuens biologis dari protein (sejak awal 1950-an) dan asam nukleat (sejak 1960-an) mengawali perkembangan basis data dan teknik analisis sekuens biologis. Basis data sekuens protein mulai dikembangkan pada tahun 1960-an di Amerika Serikat, sementara basis data sekuens DNA dikembangkan pada akhir 1970-an di Amerika Serikat dan Jerman (pada European Molecular Biology Laboratory, Laboratorium Biologi Molekular Eropa). Penemuan teknik sekuensing DNA yang lebih cepat pada pertengahan 1970-an menjadi landasan terjadinya ledakan jumlah sekuens DNA yang berhasil diungkapkan pada 1980-an dan 1990-an, menjadi salah satu pembuka jalan bagi proyek-proyek pengungkapan genom, meningkatkan kebutuhan akan pengelolaan dan analisis sekuens, dan pada akhirnya menyebabkan lahirnya bioinformatika.

Bidang-bidangnya

1. Biofisika
Ilmu yang diperuntukan dalam mengenal teknik-teknik dari ilmu fisika serta memahami struktur tersebut yang membutuhkan penggunaan IT.

2. Komputasional Biologi


Bidang yang merupakan bagian dari bioinformatika yang paling dekat dengan bidang Biologi umum klasik. Fokus dari Computational Biology adalah gerak evolusi, populasi, dan biologi teoritis daripada biomedis dalam molekul dan sel. Pada penerapan bidang ini model-model statistika untuk fenomena biologi lebih di pakai dibandingkan dengan model sebenarnya.

3. Informatika Medis


Ilmu yang baru yang didefinisikan sebagai pembelajaran, penemuan, dan implementasi dari struktur dan algoritma untuk meningkatkan komunikasi, pengertian, dan manajemen informasi medis. Berkaitan dengan data-data yang didapatkan pada level biologi yang lebih “rumit”, dimana sebagian besar bioinformatika lebih memperhatikan informasi dari sistem dan struktur biomolekul dan seluler.

4. Proteomics



Pertama kali digunakan utnuk menggambarkan himpunan dari protein-protein yang tersusun oleh genom. Mengkarakterisasi banyaknya puluhan ribu protein yang dinyatakan dalam sebuah tipe sel yang diberikan pada waktu tertentu melibatkan tempat penyimpanan dan perbandingan dari data yang memiliki jumlah yang sangat besar.

5. Genomics



Bidang ilmu sebelum selesainya sekuen genom, kecuali dalam bentuk yang paling kasar. Genomics adalah setiap usaha untuk menganalisa atau membandingkan seluruh komplemen genetik dari satu spesies atau lebih.


Referensi:

http://akasharecord.blogspot.com/2012/06/bioinformatika-dan-bidang-yang-terkait.html
http://id.wikipedia.org/wiki/Bioinformatika

Komputasi dan Paralel Processing



Komputasi paralel adalah penggunaan simultan lebih dari satu CPU atau inti prosesor yang difokuskan dalam menjalankan suatu program atau beberapa komputasi . Idealnya , parallel processing membuat suatu program berjalan lebih cepat yang dikarenakan adanya mesin tambahan ( CPU atau core ) dalam menjalankannya . Dalam prakteknya , seringkali sulit dalam membagi program sedemikian rupa seperti CPU atau core yang terpisah dapat mengeksekusi bagian yang berbeda tanpa mengganggu satu sama lain . Sebagian besar komputer hanya terdiri atau memiliki satu CPU , tetapi beberapa model dapat juga memiliki lebih. Bahkan ada komputer dengan ribuan CPU.
Komputasi paralel juga merupakan suatu bentuk komputasi yang dimana banyak perhitungan dilakukan secara bersamaan yang beroperasi dengan prinsip bahwa masalah besar sering dapat dibagi menjadi lebih kecil dan kemudian diselesaikan secara bersamaan atau secara paralel.
Komputasi paralel adalah teknik melakukan komputasi secara bersamaan dengan memanfaatkan beberapa komputer secara bersamaan. Biasanya diperlukan saat kapasitas yang diperlukan sangat besar, baik karena harus mengolah data dalam jumlah besar ataupun karena tuntutan proses komputasi yang banyak.

Pemrograman paralel adalah teknik pemrograman komputer yang memungkinkan eksekusi perintah/operasi secara bersamaan baik dalam komputer dengan satu (prosesor tunggal) ataupun banyak (prosesor ganda dengan mesin paralel) CPU. Tujuan utama dari pemrograman paralel adalah untuk meningkatkan performa komputasi.
Keuntungan Paralel Processing yakni waktu eksekusi lebih cepat dan throughput jadi lebih tinggi.
Namun kekurangannya,hardware yang dibutuhkan lebih banyak, dan juga persyaratan daya lebih tinggi, tidak baik untuk yang berdaya rendah dan juga perangkat mobile, serta membutuhkan biaya yang mahal karena penggunaan prosesor yang banyak.

Hubungannya dikarenakan penggunaan komputer atau komputasi sudah dianggap lebih cepat dibandingkan dengan penyelesaian masalah secara manual, maka diperlukan sebuah peningkatan kinerja atau proses komputasi yang akan diterapkan tentunya, yakni salah satunya adalah dengan cara meningkatkan kecepatan perangkat kerasnya yang dimana komponen utama pada perangkat keras komputer yang biasa disebut processor. Sedangkan parallel processing adalah penggunaan beberapa processor (multiprocessor atau arsitektur komputer dengan banyak processor) agar kinerja komputer semakin cepat atau ditingkatkan.

Referensi:
http://en.wikipedia.org/wiki/Parallel_processing
http://networkedblogs.com/v8YUt
http://en.wikipedia.org/wiki/Parallel_computing

4.11.2014

Teknologi Komputasi Modern

Teknologi komputasi merupakan sebuah aktivitas penggunaan dan pengembangan teknologi komputer,perangkat keras, dan perangkat lunak komputer. Ia merupakan bagian spesifik komputer dari teknologi informasi. Ilmu komputer adalah kajian dan ilmu dasar teori informasi dan komputasi serta implementasi dan aplikasinya dalam sistem komputer.

Komputasi bisa diartikan sebagai cara untuk menemukan pemecahan masalah dari data input dengan menggunakan suatu algoritma. Hal ini ialah apa yang disebut dengan teori komputasi, suatu sub-bidang dari ilmu komputer dan matematika. Selama ribuan tahun, perhitungan dan komputasi umumnya dilakukan dengan menggunakan penadan kertas, atau kapur dan batu tulis, atau dikerjakan secara mental, kadang-kadang dengan bantuan suatu tabel. Namun sekarang, kebanyakan komputasi telah dilakukan dengan menggunakan komputer.

Secara umum Ilmu komputasi adalah bidang ilmu yang mempunyai perhatian pada penyusunan model matematika dan teknik penyelesaian numerik serta penggunaan komputeruntuk menganalisis dan memecahkan masalah-masalah ilmu (sains). Dalam penggunaan praktis, biasanya berupa penerapan simulasi komputer atau berbagai bentuk komputasi lainnya untuk menyelesaikan masalah-masalah dalam berbagai bidang keilmuan, tetapi dalam perkembangannya digunakan juga untuk menemukan prinsip-prinsip baru yang mendasar dalam ilmu.

Bidang ini berbeda dengan ilmu komputer (computer science), yang mengkaji komputasi, komputer dan pemrosesan informasi. Bidang ini juga berbeda dengan teori dan percobaan sebagai bentuk tradisional dari ilmu dan kerja keilmuan. Dalam ilmu alam, pendekatan ilmu komputasi dapat memberikan berbagai pemahaman baru, melalui penerapan model-model matematika dalam program komputer berdasarkan landasan teori yang telah berkembang, untuk menyelesaikan masalah-masalah nyata dalam ilmu tersebut.

Sedikit sejarah mengenai teknologi komputasi modern
John Von Neuman adalah seorang ilmuwan yang pertama kali mencetuskan dasar – dasar komputasi modern. Beliau lahir di Budapest, ibukota Hungaria pada 28 Desember 1903 dengan nama Neumann Janos.
Beliau merupakan anak pertama dari pasangan Neumann Miksa dan Kann Margit. Di sana, nama keluarga di letakkan di depan nama asli. Sehingga dalam bahasa Inggris, nama orang tuanya menjadi Max Neumann. Pada saat Max Neumann memperoleh gelar, maka namanya berubah menjadi Von Neumann. Kegeniusannya dalam Matematika telah terlihat semenjak kecil dengan mampu melakukan pembagian bilangan delapan digit (angka) di dalam kepalanya. Pada usia 17 tahun, Von Neumann sudah mempublikasikan paper-nya sendiri untuk Journal of the German Mathematical Society. Pada tahun 1926, Von Neumann lulus dengan dua gelar yaitu gelas S1 pada bidang teknik kimia dari ETH dan gelar doktor (Ph.D) pada bidang matematika dari Universitas Budapest. Semua itu di peroleh pada usia 23 tahun. Semasa hidupnya Von Neumann telah menjadi ilmuwan besar abad 21 dengan meningkatkan karya – karyanya tidak hanya dalam bidang matematika, teori kuantum dan game theory, namun juga fisika nuklir dan ilmu komputer. Beliau juga salah seorang ilmuwan yang berpengaruh dalam pembuatan bom atom di Los Alamos pada perang Dunia II.

Macam-macam komputasi modern
1. Mobile computing
       Mobile computing atau komputasi bergerak memiliki beberapa penjelasan, salah satunya komputasi bergerak merupakan kemajuan teknologi komputer sehingga dapat berkomunikasi menggunakan jaringan tanpa menggunakan kabel dan mudah dibawa atau berpindah tempat, tetapi berbeda dengan komputasi nirkabel. Contoh dari perangkat komputasi bergerak seperti GPS, juga tipe dari komputasi bergerak seperti smart phone, dan lain sebagainya.

2. Grid computing
          Komputasi grid menggunakan komputer yang terpisah oleh geografis, didistibusikan dan terhubung oleh jaringan untuk menyelasaikan masalah komputasi skala besar. Ada beberapa daftar yang dapat dugunakan untuk mengenali sistem komputasi grid, adalah :
-        Sistem untuk koordinat sumber daya komputasi tidak dibawah kendali pusat.
-        Sistem menggunakan standard dan protocol yang terbuka.
-        Sistem mencoba mencapai kualitas pelayanan yang canggih, yang lebih baik diatas kualitas komponen individu pelayanan komputasi grid.

3. Cloud computing
          Komputasi cloud merupakan gaya komputasi yang terukur dinamis dan sumber daya virtual yang sering menyediakan layanan melalui internet. Komputasi cloud menggambarkan pelengkap baru, konsumsi dan layanan IT berbasis model dalam internet, dan biasanya melibatkan ketentuan dari keterukuran dinamis dan sumber daya virtual yang sering menyediakan layanan melalui internet.
Adapun perbedaan antara komputasi mobile, komputasi grid dan komputasi cloud, dapat dilihat penjelasannya dibawah ini :
-        Komputasi mobile menggunakan teknologi komputer yang bekerja seperti handphone, sedangkan komputasi grid dan cloud menggunakan komputer.
-        Biaya untuk tenaga komputasi mobile lebih mahal dibandingkan dengan komputasi grid dan cloud.
-        Komputasi mobile tidak membutuhkan tempat dan mudah dibawa kemana-mana, sedangkan grid dan cloud membutuhkan tempat yang khusus.
-           Untuk komputasi mobile proses tergantung si pengguna, komputasi grid proses tergantung pengguna mendapatkan server atau tidak, dan komputasi cloud prosesnya membutuhkan jaringan internet sebagai penghubungnya.

Referensi:

3.13.2014

Penerapan Komputasi Modern pada McD

Diawali dengan pengertian apa itu yang dimaksud dengan komputasi modern?
Komputasi modern adalah suatu konsep sistem yang dimana berguna untuk menerima berbagai instruksi dan menyimpannya dalam sebuah memory, memory disini bisa juga dari memory komputer. Oleh karena pada saat ini kita melakukan komputasi menggunakan komputer maka dapat dikatakan merupakan sebuah komputasi modern. Secara tidak langsung komputasi modern mampu menjadi suatu konsep dalam pemecahan masalah menggunakan komputer untuk menghasilkan informasi-informasi yang bermanfaat bagi pengguna dalam kehidupan sehari-sehari.

Komputasi modern menghitung dan mencari solusi dari masalah yang ada, dan perhitungan yang dilakukan tersebut meliputi:
1. Akurasi (big, Floating point),
2. Kecepatan (dalam satuan Hz),
3. Problem Volume Besar (Down Sizzing atau pararel),
4. Modeling (NN & GA),
5. Kompleksitas (Menggunakan Teori big O).

Jenisnya pun beragam, antara lain:

1. Mobile computing
Mobile computing atau komputasi bergerak memiliki beberapa penjelasan, salah satunya komputasi bergerak merupakan kemajuan teknologi komputer sehingga dapat berkomunikasi menggunakan jaringan tanpa menggunakan kabel dan mudah dibawa atau berpindah tempat, tetapi berbeda dengan komputasi nirkabel. Contoh dari perangkat komputasi bergerak seperti GPS, juga tipe dari komputasi bergerak seperti smartphone, dan lain sebagainya.

2. Grid computing
Komputasi grid menggunakan komputer yang terpisah oleh geografis, didistibusikan dan terhubung oleh jaringan untuk menyelasaikan masalah komputasi skala besar. Ada beberapa daftar yang dapat dugunakan untuk mengenali sistem komputasi grid, adalah :
Sistem untuk koordinat sumber daya komputasi tidak dibawah kendali pusat.
Sistem menggunakan standard dan protocol yang terbuka.
Sistem mencoba mencapai kualitas pelayanan yang canggih, yang lebih baik diatas kualitas komponen individu pelayanan komputasi grid.

3. Cloud computing
Komputasi cloud merupakan gaya komputasi yang terukur dinamis dan sumber daya virtual yang sering menyediakan layanan melalui internet. Komputasi cloud menggambarkan pelengkap baru, konsumsi dan layanan IT berbasis model dalam internet, dan biasanya melibatkan ketentuan dari keterukuran dinamis dan sumber daya virtual yang sering menyediakan layanan melalui internet.

Adapun perbedaan antara komputasi mobile, komputasi grid dan komputasi cloud, yakni:
-Komputasi mobile menggunakan teknologi komputer yang bekerja seperti handphone, sedangkan komputasi grid dan cloud menggunakan komputer.
-Biaya untuk tenaga komputasi mobile lebih mahal dibandingkan dengan komputasi grid dan cloud.
-Komputasi mobile tidak membutuhkan tempat dan mudah dibawa kemana-mana, sedangkan grid dan cloud membutuhkan tempat yang khusus.
-Untuk komputasi mobile proses tergantung si pengguna, komputasi grid proses tergantung pengguna mendapatkan server atau tidak, dan komputasi cloud prosesnya membutuhkan jaringan internet sebagai penghubungnya.

Sebagai contoh penerapannya pada McD, dapat dilihat dengan membuka alamat webnya http://www.mcdonalds.co.id yang ditampilkan berupa home dari web tersebut.


Dari halaman home tersebut dapat dilanjutkan kembali dengan memilih pesan online, fitur pesan online ini lah yang bisa disebut sebuah komputasi modern, yang dimana berfungsi memudahkan konsumen untuk menikmati produk yang ditawarkan tanpa harus datang atau dengan kata lain dapat dilakukan secara online, bisa juga dengan contoh lain seperti pemesanan tiket pesawat, tiket kereta atau sebagainya.

Setelah memilih pesan online, muncul sebuah halaman baru dengan tampilan sebagai berikut:

Dimulai dengan memilih kota anda berada,


Misalkan dipilih Depok, maka selanjutnya akan tersedia pilihan kembali yakni McStorenya, dimana kita dapat memilih McD mana yang lebih dekat dengan tempat tinggal,


sebagai contoh McD Depok Kelapa Dua dan juga dikarenakan 24 hours.

Setelah itu akan muncul beberapa menu yang dapat dipesan, hanya cukup memasukkan jumlah pesanan menu yang ingin dipesan disamping menu yang dipilih.




Diakhir pemesanan, disediakan data yang harus diisi untuk keterangan sebagai pemesan, sehingga memudahkan pihak McD dalam pengiriman pesanan kepada konsumen.


Setelah merasa cukup lengkap dan benar dengan data yang diinputkan maka dilanjutkan kembali dengan menekan tombol Pesan Order.

Berikut contoh Detail Ordernya


Komentar:
Pada website tersebut sudah termasuk penerapan komputasi modern yang dapat dirasakan pada layanan pemesanan onlinenya. Konsumen atau user dapat memesan produk yang disediakan hanya dengan online tanpa harus datang langsung untuk memesan.
Kelebihan dari website ini mudah diakses dimana saja dan kapan saja tidak terkecuali dengan bantuan smartphone sekalipun, selama terhubung dengan jaringan internet dan kemudahan dalam penggunaan pun dirasakan tanpa membuang waktu untuk memahami dalam penggunaannya, arti kata dalam penggunaan untuk memesan secara online tentunya. Kekurangan pada website ini tidak disertai gambar menunya, hanya teks list menu dan harganya tanpa gambar, untuk yang terbiasa memesan tentu tidak dipermasalahkan namun bagi pengguna atau konsumen baru mungkin lebih mudah mengenali dan tertarik dengan melihat terlebih dahulu gambar dari tiap produk.

Jadi dengan adanya penerapan teknik komputasi modern pada website McDonald's Indonesia ini sangat membantu konsumen sehingga dapat memesan tanpa harus berpergian keluar, dengan kata lain tidak perlu repot keluar, tinggal pesan saja maka pesanan akan diantar sesuai dengan data yang dicantumkan tentunya secara lengkap dan benar.

Referensi: